Pembangunan peternakan diarahkan untuk meningkatkan populasi maupun produksi ternak dan hasil-hasilnya serta meningkatkan konsumsi protein hewani dengan tujuan untuk mencukupi permintaan dalam negeri guna menuju swasembada protein.
Kabupaten Kupang mempunyai lahan potensial untuk dijadikan padang penggembalaan seluas 15.465 Hal ini memungkinkan kabupaten Kupang sebagai sebuah alternatif untuk pengembangan industri peternakan. Misalnya Ternak Sapi Bali Timur sebanyak 134.120 ekor dengan penyebarannya di Kec.Kupang Timur, Amarasi, Fatuleu, Amfoang Selatan, Amfoang Utara, Takari dan Kupang Barat sedang dikembangkan di kabupaten Kupang.

Sapi kopel juga dikembangkan di kabupaten Kupang dengan jumlah keseluruhan, 2.832 ekor, dan populasi sapi kopel terbanyak berada di daerah Kecamatan Amfoang Selatan dengan total 512 ekor dan Amfoang Barat berjumlah 468 ekor.




Pada beberapa tahun terakhir ini populasi ternak dari tahun ke tahun semakin menurun sebagai akibat tingginya daya beli dan tingkat konsumerisme masyarakat baik untuk eksport maupun konsumsi lokal sementara disatu sisi produktivitas ternak semakin menurun. Hal ini membutuhkan adanya perbaikan mutu pejantan yang berkualitas baik dan juga perlunya pengadaan sapi betina/sapi bibit (sapi kopel). Jenis-jenis ternak yang saat ini diusahakan di Kabupaten Kupang antara lain sapi, kerbau, kuda, kambing/domba dan babi. Selain ternak, masyarakat juga memelihara beberapa jenis unggas yaitu ayam dan itik.


Data Total Ternak Besar Tahun 2006-2008
 

Tahun
Jenis Ternak
Sapi
Kerbau
Kuda
2006
147.508
6.715
11.726
2007
151.196
6.755
11.996
2008
154.976
6.796
12.272
Jumlah
453.680
20.266
35.994
 Populasi Ternak di Kabupaten Kupang Tahun 2006: 
JENIS TERNAK
POPULASI (ekor)
Sapi potong
140.910
Kerbau
6.675
Kambing
79.525
Domba
31.417
Babi
72.476
Ayam Buras
212.829
Itik
2.579.420
  POPULASI TERNAK BESAR MENURUT JENIS TERNAKDI SETIAP KECAMATAN TAHUN 2006 
No
Kecamatan
Sapi
Kerbau
Kuda
1
Raijua
0
351
336
2
Sabu Barat
428
3,666
3,046
3
Hawu Mehara
0
0
0
4
Sabu Timur
127
694
692
5
Sabu Liae
0
0
0
6
Sabu Tengah
0
0
0
7
Semau
7,633
44
339
8
Semau Selatan
0
0
0
9
Kupang Barat
9,146
44
99
10
Nekamese
0
0
0
11
KupangTengah
6,025
16
100
12
Taebenu
0
0
0
13
Amarasi
18,316
15
1,227
14
Amarasi Barat
0
0
0
15
Amarasi Selatan
0
0
0
16
Amarasi Timur
0
0
0
17
Kupang Timur
33,485
1,209
1,205
18
Amabi Oefeto Timur
0
0
0
19
Amabi Oefeto
0
0
0
20
Sulamu
7,583
35
988
21
Fatuleu
16,366
346
720
22
Fatuleu Barat
0
0
0
23
Fatuleu Tengah
0
0
0
24
Takari
14,954
14
116
25
Amfoang Selatan
15,664
172
1,894
26
Amfoang Barat Daya
0
0
0
27
Amfoang Utara
14,706
108
965
28
Amfoang BaratLaut
0
0
0
29
Amfoang Timur
0
0
0
Jumlah
144,433
6,714
11,727
  POPULASI TERNAK KECIL MENURUT JENIS TERNAKDI SETIAP KECAMATAN TAHUN 2006 
No
Kecamatan
Kambing
Domba
Babi
1
Raijua
6,288
2,038
317
2
Sabu Barat
21,042
9,237
8,858
3
Hawu Mehara
0
0
0
4
Sabu Timur
23,221
21,420
2,991
5
Sabu Liae
0
0
0
6
Sabu Tengah
0
0
0
7
Semau
3,227
0
2,967
8
Semau Selatan
0
0
0
9
Kupang Barat
4,254
0
6,052
10
Nekamese
0
0
0
11
KupangTengah
2,538
0
5,258
12
Taebenu
0
0
0
13
Amarasi
6,222
0
16,944
14
Amarasi Barat
0
0
0
15
Amarasi Selatan
0
0
0
16
Amarasi Timur
0
0
0
17
Kupang Timur
3,773
0
2,923
18
Amabi Oefeto Timur
0
0
0
19
Amabi Oefeto
0
0
0
20
Sulamu
2,949
14
2,548
21
Fatuleu
1,577
14
5,832
22
Fatuleu Barat
0
0
0
23
Fatuleu Tengah
0
0
0
24
Takari
5,022
0
4,444
25
Amfoang Selatan
859
4
7,803
26
Amfoang Barat Daya
0
0
0
27
Amfoang Utara
2,529
5
9,888
28
Amfoang BaratLaut
0
0
0
29
Amfoang Timur
0
0
0
Jumlah
83,501
32,732
76,825
  Data Inseminasi Buatanmulai Tahun 2002 sampai 2006: 
NO
TAHUN
JUMLAH DOSIS/
AKSEPTOR (DOSIS)
PKB (EKOR)
KELAHIRAN (EKOR)
1
2002
3.000
2.000
416
2
2003
 2.747
2.271
554
3
2004
2.192
1.996
467
4
2005
3.000
2.000
469
5
2006
2.305
2.000
662
Jumlah
13244
13.244
10.267
  Sumber : Dinas Peternakan Kab. Kupang, 2007  PROGRAM VAKSINASI 
NO
JENIS VAKSIN
JENIS
TERNAK
TERNAK YG DI VAKSIN
2005
2006
1
SE
Sapi
46.785
56.785
 
 
Kerbau
1.789
4.567
Babi
6.750
3.568
2
Anthrax
Sapi
6.850
5.222
  
Kerbau
1.150
3.567
3
Hoc Cholera
Babi
1.450
2.300
4
Distemper
Anjing
6
10
5
Parvo
Anjing
6
10
6
ND
Ayam
6.175
6.787
JUMLAH
72.966
82.816
  Sumber : Dinas Peternakan Kab. Kupang, 2007  PENGOBATAN TERNAK 

 
NO
 
JENIS TERNAK
TERNAK YG DI OBATI (EKOR)
2005
2006
1
Sapi
61.215
69.300
2
Kerbau
3.450
1.875
3
Kuda
1.450
1.240
4
Kambing
1.575
1.875
5
Babi
2.495
3.200
6
Anjing
78
124
7
Kucing
1.950
18
8
Kera
2
5
9
Unggas
1.950
2.340
Jumlah
74.165
9.977
  *) Penanganan Penyakit Brucellosis = 128 ekor Sapi Betina
 Sumber : Dinas Peternakan Kab. Kupang